Modélisation d'homologie Insilico et étude de docking du TCTP de Labeo rohita (in French) - Murthy, Meesala Krishna ; Samal, Dibyaranjan ; Khandayataray, Pratima
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Synopsis "Modélisation d'homologie Insilico et étude de docking du TCTP de Labeo rohita (in French)"
La protéine tumorale contrôlée par translation (TCTP) est une protéine associée à la croissance, présente de manière ubiquitaire dans une grande variété d'organismes, de la levure aux mammifères. En fait, elle est l'une des 20 protéines les plus abondamment exprimées dans la cellule. La TCTP a été initialement identifiée dans une lignée cellulaire de tumeur d'ascite d'Ehrlich, d'où son nom. Par la suite, il a été démontré que la TCTP était présente dans presque toutes les cellules normales. Le TCTP est également connu sous les noms de facteur de libération de l'histamine dépendant de l'IgE (HRF), p23/p21 et fortiline. La TCTP a un poids d'environ 20-25 kDa. La première structure de TCTP a été résolue par spectroscopie RMN en 2001 à partir de Schizosaccharomyces pombe. La prédiction de la structure tertiaire des protéines est appliquée pour développer des modèles de structure des protéines lorsque les contraintes de la diffraction des rayons X ou de la spectroscopie RMN ne sont pas disponibles. La prédiction de la structure tertiaire des protéines est une approche bioinformatique qui tente de générer une nouvelle structure à partir de la connaissance préalable de la structure des protéines. Pour prédire ou modéliser la structure 3D d'une protéine, trois méthodes différentes sont utilisées: la modélisation par homologie (ou comparative), le filtrage et la méthode ab initio. La structure 3D des protéines est nécessaire à la compréhension de leur fonction.
