Synopsis "In silico идентификация микроор (in Russian)"
В данной работе использован подход in silico для идентификации и характеристики консервативных миРНК в тегах экспрессированных последовательностей (ESTs) чечевицы. Для идентификации новых миРНК в чечевице EST-последовательности были проверены на гомологию с известными зрелыми миРНК растительного царства Viridiplantae с помощью онлайн BLASTN. В результате вычислительной идентификации на основе сравнительной геномики было выявлено 12 потенциальных кандидатов в миРНК, принадлежащих к 12 различным семействам миРНК в чечевице. Наконец, используя потенциальные миРНК чеснока, было предсказано 25 целевых генов и показаны их возможные функции. Большинство генов-мишеней миРНК чечевицы кодируют рост, развитие, метаболизм, реакцию на стресс, устойчивость к болезням и т.д. В ближайшем будущем улучшение понимания молекулярных механизмов миРНК в растении чечевица может помочь в разработке новых и точных методов для понимания некоторых посттранскрипционных механизмов сайленсинга генов в ответ на стрессоустойчивос